Protein–RNA interactions for Protein: B8QI36

Ppfia4, Liprin-alpha 4, mousemouse

Predictions only

Length 1,187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppfia4B8QI36 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ppfia4B8QI36 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia4B8QI36 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia4B8QI36 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia4B8QI36 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia4B8QI36 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ppfia4B8QI36 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Ppfia4B8QI36 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms