Protein–RNA interactions for Protein: B4XVP9

Phf11c, PHD finger protein 11C, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Phf11cB4XVP9 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Kcnq2-204ENSMUST00000103047 2899 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.14
Phf11cB4XVP9 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Myef2-201ENSMUST00000067780 2999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Phf11cB4XVP9 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms