Protein–RNA interactions for Protein: B2RY53

Gm6133, EG620155 protein, mousemouse

Predictions only

Length 190 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6133B2RY53 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Gm6133B2RY53 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Khdrbs2-201ENSMUST00000027226 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 2310035C23Rik-202ENSMUST00000086721 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Tma7-201ENSMUST00000167504 944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm28626-201ENSMUST00000187004 520 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Lmo1-203ENSMUST00000208136 772 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Rps4l-201ENSMUST00000071745 943 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Kcnd3-202ENSMUST00000098761 7169 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Slc29a1-222ENSMUST00000171847 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ppp3cb-206ENSMUST00000161989 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
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Gm6133B2RY53 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Gm6376-201ENSMUST00000209407 580 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Map4k4-201ENSMUST00000163854 5782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Gm6133B2RY53 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
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