Protein–RNA interactions for Protein: B2RXC6

Polr3a, DNA-directed RNA polymerase subunit, mousemouse

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr3aB2RXC6 Haghl-201ENSMUST00000077938 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Tekt1-202ENSMUST00000108502 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Gm15690-201ENSMUST00000128728 432 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Rpl18-204ENSMUST00000209693 535 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Polr3aB2RXC6 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Ube2e1-201ENSMUST00000022296 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Nat9-203ENSMUST00000103040 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Nat9-204ENSMUST00000103041 953 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Mir8098-201ENSMUST00000184011 137 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Ptn-201ENSMUST00000101534 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Krt28-201ENSMUST00000006963 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Ankra2-201ENSMUST00000022164 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Ggnbp1-201ENSMUST00000053683 1525 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Rprl3-201ENSMUST00000157400 290 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Rgs6-206ENSMUST00000186309 1693 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Gm13830-201ENSMUST00000124378 417 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Ccdc30-201ENSMUST00000044781 1464 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Bhlhe41-202ENSMUST00000111703 744 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Polr3aB2RXC6 Ssr2-205ENSMUST00000193934 569 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.9 ms