Protein–RNA interactions for Protein: B2RX70

Cped1, Cadherin-like and PC-esterase domain-containing 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,026 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cped1B2RX70 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm18959-201ENSMUST00000208954 655 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Apba1-201ENSMUST00000025830 6632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Rps5-202ENSMUST00000108539 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Mgat1-201ENSMUST00000081794 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Cped1B2RX70 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.5 ms