Protein–RNA interactions for Protein: B2RW38

Cfap58, Cilia- and flagella-associated protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 873 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap58B2RW38 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Tmem214-201ENSMUST00000114716 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Fiz1-201ENSMUST00000077385 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Rgs7-203ENSMUST00000192227 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Cfap58B2RW38 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Agk-201ENSMUST00000031977 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Cfap58B2RW38 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.2 ms