Protein–RNA interactions for Protein: B2RW27

1700018F24Rik, 1700018F24Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700018F24RikB2RW27 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
1700018F24RikB2RW27 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ubp1-202ENSMUST00000084885 3850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ap1m1-201ENSMUST00000003117 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 4930474N05Rik-203ENSMUST00000226305 2313 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
1700018F24RikB2RW27 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms