Protein–RNA interactions for Protein: B2RV77

Gm5483, MCG130182, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 97 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5483B2RV77 Lgr6-201ENSMUST00000044828 6675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Cep83-201ENSMUST00000020212 3639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Slc35d2-204ENSMUST00000222168 472 ntTSL 3 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Rasl10b-202ENSMUST00000108140 3156 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Pld6-202ENSMUST00000125307 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Bvht-202ENSMUST00000183087 588 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Gm5483B2RV77 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms