Protein–RNA interactions for Protein: B2RV38

Rd3l, BC048943 protein, mousemouse

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Length 197 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rd3lB2RV38 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Zfp879-203ENSMUST00000109134 2414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Zfp879-201ENSMUST00000049625 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Ralgapa1-201ENSMUST00000085385 7901 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Slc35f1-201ENSMUST00000105473 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gm28372-201ENSMUST00000188900 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Kcnq4-201ENSMUST00000030376 3919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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Rd3lB2RV38 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Msl1-201ENSMUST00000037915 4593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Rd3lB2RV38 Nanos1-201ENSMUST00000088237 3927 ntAPPRIS P1 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Rd3lB2RV38 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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