Protein–RNA interactions for Protein: B2RUJ5

Apba1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, mousemouse

Predictions only

Length 842 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apba1B2RUJ5 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Btbd1-201ENSMUST00000026093 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 AC165249.1-201ENSMUST00000220031 1599 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Vmn1r207-ps-201ENSMUST00000119931 1073 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Faap20-210ENSMUST00000178473 1076 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm16432-201ENSMUST00000094273 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 AC159205.3-201ENSMUST00000224614 874 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Apba1B2RUJ5 Gdf1-201ENSMUST00000207684 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm14716-201ENSMUST00000120138 718 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Apba1B2RUJ5 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.45■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.2 ms