Protein–RNA interactions for Protein: B2RU80

Ptprb, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,998 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprbB2RU80 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Cyp26b1-203ENSMUST00000204109 1340 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Psmb1-201ENSMUST00000014913 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 AC132104.2-201ENSMUST00000215011 266 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
PtprbB2RU80 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Stk3-201ENSMUST00000018476 2914 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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PtprbB2RU80 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
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PtprbB2RU80 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Zfp655-206ENSMUST00000200039 1765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 D10Jhu81e-201ENSMUST00000001242 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.88□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtprbB2RU80 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ak5-201ENSMUST00000045262 3323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtprbB2RU80 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
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PtprbB2RU80 Fcgrt-203ENSMUST00000210642 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Ocel1-201ENSMUST00000002469 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm9449-201ENSMUST00000207265 1011 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm18195-201ENSMUST00000207604 706 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Nudt14-203ENSMUST00000221497 355 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
PtprbB2RU80 Neil3-201ENSMUST00000047768 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
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