Protein–RNA interactions for Protein: B2RU40

Prrt4, Proline-rich transmembrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 902 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt4B2RU40 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tex261-201ENSMUST00000014892 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Sppl3-201ENSMUST00000031530 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Lrrc7-201ENSMUST00000106044 5918 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Prrt4B2RU40 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms