Protein–RNA interactions for Protein: B2RRL2

Jrkl, Jerky protein homolog-like, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrklB2RRL2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Coro1a-202ENSMUST00000106364 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Leprotl1-201ENSMUST00000033910 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Gnas-202ENSMUST00000087871 3903 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Yipf4-201ENSMUST00000024873 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Ndufs2-202ENSMUST00000111318 1545 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Aptx-203ENSMUST00000108103 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Fam72a-201ENSMUST00000068613 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
JrklB2RRL2 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Fbxl21-201ENSMUST00000045428 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Cdc27-202ENSMUST00000106961 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Fam171a1-203ENSMUST00000091505 3449 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Atp5b-201ENSMUST00000026459 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
JrklB2RRL2 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.9 ms