Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE7

Otud4, OTU domain-containing protein 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,107 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otud4B2RRE7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Otud4B2RRE7 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Otud4B2RRE7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.9 ms