Protein–RNA interactions for Protein: B2RRE4

Znf518b, Zinc finger protein 518B, mousemouse

Predictions only

Length 1,077 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Znf518bB2RRE4 Mpped2-202ENSMUST00000111063 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Cul4a-202ENSMUST00000121426 1044 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Insl3-201ENSMUST00000034261 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Ube2z-201ENSMUST00000100528 3997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Taf6l-213ENSMUST00000189739 1794 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Myo16-204ENSMUST00000208309 2462 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 A730015C16Rik-201ENSMUST00000164855 1221 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Flg-207ENSMUST00000180293 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Fgf8-205ENSMUST00000111927 843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Mrps12-204ENSMUST00000171183 883 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Znf518bB2RRE4 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms