Protein–RNA interactions for Protein: B2RRD7

Brpf1, Peregrin, mousemouse

Predictions only

Length 1,212 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf1B2RRD7 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Calm2-201ENSMUST00000040440 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Scly-201ENSMUST00000027532 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Zkscan8-202ENSMUST00000110481 728 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Brpf1B2RRD7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Brpf1B2RRD7 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms