Protein–RNA interactions for Protein: B2KF50

Uhrf1bp1, UHRF1 (ICBP90)-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uhrf1bp1B2KF50 Mthfsl-204ENSMUST00000186863 725 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Irf7-202ENSMUST00000097952 1764 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Polr2f-201ENSMUST00000040077 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Chaf1b-201ENSMUST00000023666 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Hist1h1a-201ENSMUST00000055770 741 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Eva1c-201ENSMUST00000037539 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Hebp2-203ENSMUST00000214548 2083 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 CAAA01066804.1-201ENSMUST00000217800 611 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Uhrf1bp1B2KF50 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Serinc2-203ENSMUST00000122374 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Lncpint-201ENSMUST00000115107 1676 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Atp5a1-201ENSMUST00000026495 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ccdc174-201ENSMUST00000037783 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap2-209ENSMUST00000152652 3842 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm5091-201ENSMUST00000181658 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Sctr-201ENSMUST00000072886 2012 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Cd82-205ENSMUST00000116457 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Slc38a10-203ENSMUST00000076697 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Rab35-201ENSMUST00000031492 2820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ogfod3-201ENSMUST00000026169 1308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Tatdn2-202ENSMUST00000113022 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm9889-202ENSMUST00000206983 1577 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Kdm1a-202ENSMUST00000105847 3028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Klhl33-202ENSMUST00000170855 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Dbnl-202ENSMUST00000102928 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Kifc3-203ENSMUST00000169748 3384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Rnf170-208ENSMUST00000153528 1026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Npcd-201ENSMUST00000023060 1162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Mir22hg-202ENSMUST00000149940 1752 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Fip1l1-203ENSMUST00000113535 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Gm13446-201ENSMUST00000124555 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Uhrf1bp1B2KF50 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms