Protein–RNA interactions for Protein: B2KF05

Brpf3, Bromodomain and PHD finger-containing, 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brpf3B2KF05 Plxnd1-201ENSMUST00000015511 6907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm17200-201ENSMUST00000170214 2022 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Kcnj6-202ENSMUST00000099508 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Klhdc10-201ENSMUST00000068240 3951 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Adipor1-202ENSMUST00000112237 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Nr1h2-203ENSMUST00000107911 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Lhfpl3-202ENSMUST00000197992 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Pbx4-201ENSMUST00000081503 1560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Stxbp3-201ENSMUST00000102621 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Glcci1-201ENSMUST00000064285 6200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Washc1-202ENSMUST00000116556 2887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Cadps2-202ENSMUST00000069074 3935 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 Taf15-201ENSMUST00000021018 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Brpf3B2KF05 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Tnfrsf1a-201ENSMUST00000032491 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Prob1-201ENSMUST00000097619 3021 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Rab6b-201ENSMUST00000035155 5007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Tes-202ENSMUST00000115467 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Brpf3B2KF05 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53 ms