Protein–RNA interactions for Protein: B1AYM9

CK137956, cDNA sequence CK137956, mousemouse

Predictions only

Length 596 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CK137956B1AYM9 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 AC156832.2-201ENSMUST00000216217 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ubr2-202ENSMUST00000113337 7633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm12781-201ENSMUST00000146269 395 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm6623-201ENSMUST00000173570 544 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Fam213b-201ENSMUST00000030935 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
CK137956B1AYM9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51 ms