Protein–RNA interactions for Protein: B1AS29

Grik3, Glutamate receptor ionotropic, kainate 3, mousemouse

Predictions only

Length 919 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik3B1AS29 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm10532-201ENSMUST00000181913 2301 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 C130032M10Rik-201ENSMUST00000180393 728 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ralb-201ENSMUST00000004565 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Pgam1-ps2-201ENSMUST00000117129 765 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Sdhaf4-201ENSMUST00000027338 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Zfand6-208ENSMUST00000209117 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Fam181a-203ENSMUST00000191218 1419 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Trip10-201ENSMUST00000019631 2224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 1500009L16Rik-201ENSMUST00000150459 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Exosc5-201ENSMUST00000079634 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Grik3B1AS29 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.1 ms