Protein–RNA interactions for Protein: B1AQJ2

Usp36, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 36, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,098 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp36B1AQJ2 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ptprj-204ENSMUST00000168621 7634 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Vkorc1-203ENSMUST00000206053 606 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Isl2-201ENSMUST00000034869 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Usp36B1AQJ2 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.7 ms