Protein–RNA interactions for Protein: A7XUY5

Skint5, Selection and upkeep of intraepithelial T-cells protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,461 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Skint5A7XUY5 Nkapl-201ENSMUST00000068235 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Qdpr-204ENSMUST00000120867 1234 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gm20383-201ENSMUST00000203799 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Tmem52-201ENSMUST00000023920 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Fbxo24-202ENSMUST00000111002 2306 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Tmem185a-201ENSMUST00000101506 2429 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Oip5-202ENSMUST00000123818 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Layn-201ENSMUST00000098782 1786 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Prdm8-201ENSMUST00000112959 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Tcp11-202ENSMUST00000043925 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gm25911-201ENSMUST00000157621 56 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gm17114-201ENSMUST00000164716 511 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Gnmt-201ENSMUST00000002846 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Prss22-201ENSMUST00000041649 1323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Tssc4-206ENSMUST00000177841 1364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Chtf8-206ENSMUST00000177068 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Skint5A7XUY5 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Tsc22d1-208ENSMUST00000142683 797 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Nptn-211ENSMUST00000177064 582 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm45208-202ENSMUST00000208156 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 AC225888.1-201ENSMUST00000227184 728 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Prlhr-201ENSMUST00000051277 1572 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Zscan12-201ENSMUST00000053293 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 AU019823-202ENSMUST00000145139 2805 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm13283-201ENSMUST00000191112 1463 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Mif4gd-201ENSMUST00000021087 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Zfp787-206ENSMUST00000208746 535 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm14641-201ENSMUST00000136486 452 ntTSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Pacs2-207ENSMUST00000223502 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 Aire-213ENSMUST00000148469 1618 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Skint5A7XUY5 E530001F21Rik-201ENSMUST00000120991 730 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.4 ms