Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS2

Gm11127, MHC classIb T15, mousemouse

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Length 374 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm11127A7VMS2 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Acox1-201ENSMUST00000066587 3987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Aifm1-202ENSMUST00000114945 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Mapk14-201ENSMUST00000004990 3547 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Gata5-201ENSMUST00000015771 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Tmem117-201ENSMUST00000080141 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm11127A7VMS2 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Mis18bp1-208ENSMUST00000222244 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
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Gm11127A7VMS2 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm11127A7VMS2 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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Gm11127A7VMS2 H6pd-201ENSMUST00000030830 4745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Sclt1-201ENSMUST00000026866 3005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Ipo8-201ENSMUST00000048418 5360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Gpr37l1-201ENSMUST00000027682 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Gm11127A7VMS2 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
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