Protein–RNA interactions for Protein: A6X8Z9

4930435E12Rik, RIKEN cDNA 4930435E12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930435E12RikA6X8Z9 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.37□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC14.36□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Csnk1a1-206ENSMUST00000165721 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.11
4930435E12RikA6X8Z9 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 B4galt3-205ENSMUST00000126699 1758 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
4930435E12RikA6X8Z9 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms