Protein–RNA interactions for Protein: A4Q9E5

Ttll3, Tubulin monoglycylase TTLL3, mousemouse

Predictions only

Length 927 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll3A4Q9E5 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Crem-203ENSMUST00000082141 2820 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Mn1-201ENSMUST00000094463 6860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Cep44-201ENSMUST00000040330 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Zdhhc15-201ENSMUST00000042070 5509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Ttll3A4Q9E5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Sgpp1-202ENSMUST00000220285 3200 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Spcs2-201ENSMUST00000036274 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Nrros-201ENSMUST00000099991 2548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Nrsn1-204ENSMUST00000167305 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Rock1-201ENSMUST00000067947 6187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Sptbn4-203ENSMUST00000108363 4724 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Ttll3A4Q9E5 Sptbn4-204ENSMUST00000108364 4740 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.8 ms