Protein–RNA interactions for Protein: A2ARA8

Itga8, Integrin alpha-8, mousemouse

Predictions only

Length 1,062 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga8A2ARA8 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gabbr1-202ENSMUST00000172789 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Fmnl3-202ENSMUST00000088233 4423 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Itga8A2ARA8 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms