Protein–RNA interactions for Protein: A2APF3

Ctcfl, Transcriptional repressor CTCFL, mousemouse

Predictions only

Length 636 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtcflA2APF3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Fbxo41-201ENSMUST00000159062 6505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Stk33-202ENSMUST00000106745 2410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 A930004D18Rik-201ENSMUST00000066163 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Nrg2-203ENSMUST00000115713 3001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Taz-201ENSMUST00000069722 1851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
CtcflA2APF3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Adamts14-201ENSMUST00000092486 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Rbm15-201ENSMUST00000061772 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Pde4a-201ENSMUST00000003395 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Fxyd3-205ENSMUST00000167369 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 E130307A14Rik-213ENSMUST00000155482 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Cog8-202ENSMUST00000095517 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.26■□□□□ 0.03
CtcflA2APF3 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC15.26■□□□□ 0.03
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