Protein–RNA interactions for Protein: A2AKX3

Setx, Probable helicase senataxin, mousemouse

Predictions only

Length 2,646 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SetxA2AKX3 Smtnl2-201ENSMUST00000050226 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
SetxA2AKX3 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Scamp5-203ENSMUST00000214256 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Csrp2-207ENSMUST00000220409 780 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 CT025535.1-201ENSMUST00000227172 491 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Pycrl-201ENSMUST00000053918 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm27494-201ENSMUST00000184735 189 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Pecr-201ENSMUST00000027381 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm9898-201ENSMUST00000065469 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Prss8-201ENSMUST00000032988 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm11764-201ENSMUST00000120221 623 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Timm10b-201ENSMUST00000058333 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 St8sia5-202ENSMUST00000079618 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Klk14-201ENSMUST00000056329 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Srsf4-202ENSMUST00000053819 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Dohh-201ENSMUST00000072751 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 B020017C02Rik-201ENSMUST00000197444 1688 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm10747-201ENSMUST00000217799 1014 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Chchd10-201ENSMUST00000058906 939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm4459-201ENSMUST00000118750 468 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm13962-201ENSMUST00000131512 611 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm8349-201ENSMUST00000182720 1003 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm7507-201ENSMUST00000183053 1008 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Lce1b-201ENSMUST00000029531 647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Mif4gd-203ENSMUST00000106507 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm11467-201ENSMUST00000129407 674 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Bcl2l2-204ENSMUST00000172844 498 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Mcee-203ENSMUST00000206194 532 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Phykpl-201ENSMUST00000020625 1609 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Hpn-202ENSMUST00000108102 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
SetxA2AKX3 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.7 ms