Protein–RNA interactions for Protein: A2AGD7

Ccdc163, Coiled-coil domain-containing 163, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc163A2AGD7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Xpa-201ENSMUST00000030013 955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Apba3-211ENSMUST00000220297 2268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Cwh43-201ENSMUST00000031040 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 6430573F11Rik-202ENSMUST00000135373 2573 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Gtf3a-201ENSMUST00000132102 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Ccdc163A2AGD7 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms