Protein–RNA interactions for Protein: A2AGA4

Rhbdl2, Rhomboid-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 302 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhbdl2A2AGA4 Rab7-203ENSMUST00000113597 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pola2-202ENSMUST00000165143 2397 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Sumo3-209ENSMUST00000174113 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Cnbd2-201ENSMUST00000037096 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Eif4g1-201ENSMUST00000044783 5444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Serf2-204ENSMUST00000139253 3056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Agpat1-201ENSMUST00000037489 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pgap3-202ENSMUST00000090827 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Ergic3-201ENSMUST00000006035 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Cfl1-201ENSMUST00000116560 1148 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Zfp691-201ENSMUST00000052715 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Adamtsl1-201ENSMUST00000048885 1842 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Arpc2-202ENSMUST00000113819 1313 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Eda-206ENSMUST00000113779 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Agfg1-208ENSMUST00000190052 2991 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Crnde-206ENSMUST00000179421 773 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Hist2h2ac-201ENSMUST00000090782 520 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Rhbdl2A2AGA4 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Disc1-201ENSMUST00000074562 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Asap2-201ENSMUST00000050990 3345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Ankrd29-201ENSMUST00000118525 3242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Stard6-203ENSMUST00000168249 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 D930007J09Rik-201ENSMUST00000057911 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Rhbdl2A2AGA4 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24 ms