Protein–RNA interactions for Protein: A2AFR2

4930447F04Rik, RIKEN cDNA 4930447F04 gene, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930447F04RikA2AFR2 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.4□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Col11a2-201ENSMUST00000087497 6048 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ofd1-201ENSMUST00000049501 4453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Sash1-201ENSMUST00000015449 7183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ehmt2-204ENSMUST00000114033 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Capn15-205ENSMUST00000212520 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 6430548M08Rik-204ENSMUST00000108951 5531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Elf2-202ENSMUST00000091144 2366 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
4930447F04RikA2AFR2 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.36□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms