Protein–RNA interactions for Protein: A2ABX0

Rbbp8nl, RBBP8 N-terminal-like, mousemouse

Predictions only

Length 614 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rbbp8nlA2ABX0 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26568-201ENSMUST00000180496 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Madcam1-201ENSMUST00000020554 1436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Zfp264-201ENSMUST00000208656 1563 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Lrig1-201ENSMUST00000032105 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Eif4a2-201ENSMUST00000023599 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Krt73-201ENSMUST00000063292 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Tbcel-201ENSMUST00000066148 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Dok7-202ENSMUST00000101298 2443 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Pyy-201ENSMUST00000017455 555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Uri1-201ENSMUST00000085513 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Npm1-201ENSMUST00000075641 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Ramp2-202ENSMUST00000122006 899 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rbbp8nlA2ABX0 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms