Protein–RNA interactions for Protein: A2A6M5

Calcoco2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Calcoco2A2A6M5 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Pitpna-206ENSMUST00000179521 3727 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Suco-201ENSMUST00000048377 6327 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Crk-201ENSMUST00000017920 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Ly6e-201ENSMUST00000051698 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Pex11a-201ENSMUST00000032761 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Comp-201ENSMUST00000003659 2416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 N4bp2os-203ENSMUST00000202673 699 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Nudt14-202ENSMUST00000221397 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Nrcam-202ENSMUST00000110748 6275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Klf7-201ENSMUST00000055001 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Eif4g1-203ENSMUST00000115457 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Rgl3-201ENSMUST00000045726 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Tssk2-201ENSMUST00000055374 1387 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Zdhhc1-203ENSMUST00000212303 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm43072-201ENSMUST00000200283 1671 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Rexo2-208ENSMUST00000216470 454 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Slc46a1-201ENSMUST00000001126 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Pitpna-203ENSMUST00000143219 3761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Rprd1a-201ENSMUST00000046206 4297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Krt83-201ENSMUST00000023718 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Tuba8-201ENSMUST00000032233 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Efna4-201ENSMUST00000029674 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Hist1h2ac-201ENSMUST00000171127 2482 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm19684-201ENSMUST00000173128 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Abr-203ENSMUST00000094012 5236 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Hhatl-201ENSMUST00000035110 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Grrp1-201ENSMUST00000060050 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Calcoco2A2A6M5 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Calcoco2A2A6M5 Mettl27-204ENSMUST00000111219 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms