Protein–RNA interactions for Protein: A2A432

Cul4b, Cullin-4B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 970 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cul4bA2A432 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Naif1-201ENSMUST00000048431 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Cul4bA2A432 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Men1-205ENSMUST00000113501 2508 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Chsy3-201ENSMUST00000080721 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Tulp1-202ENSMUST00000114794 1738 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Aga-203ENSMUST00000211424 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Ttc32-203ENSMUST00000219488 768 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Cul4bA2A432 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.6 ms