Protein–RNA interactions for Protein: A2A259

Pkd2l1, Polycystic kidney disease 2-like 1 protein, mousemouse

Predictions only

Length 760 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2l1A2A259 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Vangl2-201ENSMUST00000027837 5698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Arhgap42-201ENSMUST00000093893 6116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Pih1d1-201ENSMUST00000085375 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Pkd2l1A2A259 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms