Protein–RNA interactions for Protein: A0N8N6

Trav12-2, T cell receptor alpha variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 114 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trav12-2A0N8N6 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Drd2-201ENSMUST00000075764 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Perp-201ENSMUST00000019998 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Trav12-2A0N8N6 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Cdk9-202ENSMUST00000120105 1565 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
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Trav12-2A0N8N6 Ccdc51-201ENSMUST00000026735 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
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Trav12-2A0N8N6 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trav12-2A0N8N6 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trav12-2A0N8N6 Disc1-203ENSMUST00000098311 2597 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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Trav12-2A0N8N6 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trav12-2A0N8N6 A130010J15Rik-201ENSMUST00000110831 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trav12-2A0N8N6 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Il3ra-203ENSMUST00000224163 2315 ntAPPRIS P2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
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Trav12-2A0N8N6 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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Trav12-2A0N8N6 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Trav12-2A0N8N6 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
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