Protein–RNA interactions for Protein: A0A0U1RP08

1700028J19Rik, RIKEN cDNA 1700028J19 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 172 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem267-205ENSMUST00000223912 1789 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wipf1-202ENSMUST00000102679 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm9917-202ENSMUST00000181099 1499 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Abhd16a-201ENSMUST00000007251 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
1700028J19RikA0A0U1RP08 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rgs3-203ENSMUST00000098031 2072 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC15.71■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rbm12b2-202ENSMUST00000095143 3147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gfy-201ENSMUST00000179443 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Chn1-209ENSMUST00000166199 3876 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ankrd17-203ENSMUST00000168058 9311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Sf1-202ENSMUST00000113487 2649 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rflna-201ENSMUST00000036109 1681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lrrfip1-212ENSMUST00000189617 2155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Zkscan6-202ENSMUST00000071465 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm45203-201ENSMUST00000206384 1831 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Prss53-201ENSMUST00000121394 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Lonp2-201ENSMUST00000034141 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
1700028J19RikA0A0U1RP08 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms