Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1P5

Trbv26, T cell receptor beta, variable 26 (Fragment), mousemouse

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv26A0A0B4J1P5 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Trbv26A0A0B4J1P5 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Gxylt2-201ENSMUST00000032157 7658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
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Trbv26A0A0B4J1P5 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ubr2-201ENSMUST00000113335 5691 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Eda-209ENSMUST00000113783 4930 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trbv26A0A0B4J1P5 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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Trbv26A0A0B4J1P5 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ttll5-201ENSMUST00000040179 5081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Pldi-201ENSMUST00000036304 853 ntTSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Ralgapa2-211ENSMUST00000228797 8245 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Kdr-201ENSMUST00000113516 5924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
Trbv26A0A0B4J1P5 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
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