Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1K3

B230359F08Rik, RIKEN cDNA B230359F08 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctnna2-205ENSMUST00000161846 4018 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm26762-201ENSMUST00000180864 5284 ntTSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zdhhc8-201ENSMUST00000076957 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Trpc3-201ENSMUST00000029271 3694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ccnyl1-202ENSMUST00000114077 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ctnna2-204ENSMUST00000160894 4162 ntTSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nubpl-201ENSMUST00000040090 2987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC11.46□□□□□ -0.57
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Cbl-201ENSMUST00000037644 4901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.46□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Hey2-201ENSMUST00000019924 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fgfr2-215ENSMUST00000122054 3323 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Nipal3-201ENSMUST00000102549 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Git2-204ENSMUST00000112185 5032 ntTSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.45□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sh3bp2-203ENSMUST00000118545 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Espn-211ENSMUST00000105657 1375 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Mlec-201ENSMUST00000112121 5955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Prrg2-201ENSMUST00000007981 1295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
B230359F08RikA0A0B4J1K3 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.44□□□□□ -0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.5 ms