Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H2

Trbv13-3, T cell receptor beta, variable 13-3 (Fragment), mousemouse

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Length 113 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Pacs2-202ENSMUST00000220541 3101 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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Trbv13-3A0A0B4J1H2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Trbv13-3A0A0B4J1H2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
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