Protein–RNA interactions for Protein: A0A0B4J1H1

Trbv12-2, T cell receptor beta, variable 12-2 (Fragment), mousemouse

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Length 124 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Sh2b1-201ENSMUST00000032978 3393 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mesp2-201ENSMUST00000107394 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Vmn1r17-204ENSMUST00000228294 2084 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cgn-204ENSMUST00000155485 2361 ntTSL 2 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.27□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Clvs2-203ENSMUST00000160299 2610 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hps5-202ENSMUST00000107653 4702 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Snca-201ENSMUST00000114268 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dnajb11-204ENSMUST00000166487 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Slc6a8-206ENSMUST00000164449 2151 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shcbp1l-201ENSMUST00000042373 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nfe2-208ENSMUST00000149111 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wbp4-201ENSMUST00000022601 3704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dmrta2os-202ENSMUST00000141893 691 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Pick1-202ENSMUST00000053926 2415 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
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Trbv12-2A0A0B4J1H1 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Chpf-201ENSMUST00000079205 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rint1-205ENSMUST00000120869 1886 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Lefty2-201ENSMUST00000085797 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Spats2l-212ENSMUST00000170139 2315 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Csnk1e-201ENSMUST00000117786 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Gm28756-202ENSMUST00000209405 2461 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 AC115863.1-201ENSMUST00000214815 1813 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Trbv12-2A0A0B4J1H1 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
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