Protein–RNA interactions for Protein: A0A0A6YXJ7

Larp1b, La ribonucleoprotein domain family, member 1B (Fragment), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC159301.1-201ENSMUST00000225130 1182 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prkcg-202ENSMUST00000172109 2119 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ruvbl2-201ENSMUST00000107771 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15442-201ENSMUST00000117905 1527 ntBASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Otub1-202ENSMUST00000123594 1728 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Apbb1-205ENSMUST00000187057 1630 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mfsd10-203ENSMUST00000114331 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Itga9-201ENSMUST00000044165 7020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Uqcc2-203ENSMUST00000119227 452 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Cdca7-201ENSMUST00000102691 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hpca-203ENSMUST00000116442 1568 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Klc1-202ENSMUST00000118471 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Ubtf-206ENSMUST00000107123 2759 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Pla2g12b-201ENSMUST00000009790 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Hoxaas2-202ENSMUST00000155922 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Larp1bA0A0A6YXJ7 Lcmt2-201ENSMUST00000099486 2047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms