Protein–RNA interactions for Protein: A0A087WRF5

Gm20792, Predicted gene 28891, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20792A0A087WRF5 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Hectd1-202ENSMUST00000179265 9012 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Plppr5-201ENSMUST00000039564 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gpc1-201ENSMUST00000045970 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gigyf1-201ENSMUST00000031727 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ube2o-201ENSMUST00000082152 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Rfx5-201ENSMUST00000029772 4189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Nxpe3-201ENSMUST00000099705 6430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Gm20792A0A087WRF5 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20792A0A087WRF5 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20792A0A087WRF5 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20792A0A087WRF5 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20792A0A087WRF5 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20792A0A087WRF5 2810474O19Rik-202ENSMUST00000100765 5356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20792A0A087WRF5 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20792A0A087WRF5 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20792A0A087WRF5 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Gm20792A0A087WRF5 Hykk-201ENSMUST00000039742 5110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.8 ms