Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6H5

Zdhhc4, Probable palmitoyltransferase ZDHHC4, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zdhhc4Q9D6H5 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Zdhhc4Q9D6H5 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Zdhhc4Q9D6H5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Zdhhc4Q9D6H5 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Zdhhc4Q9D6H5 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Zdhhc4Q9D6H5 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Zdhhc4Q9D6H5 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms