Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1R7

Nek9, Serine/threonine-protein kinase Nek9, mousemouse

Predictions only

Length 984 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nek9Q8K1R7 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Nek9Q8K1R7 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC27.48■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Nek9Q8K1R7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC27.39■■□□□ 1.98
Nek9Q8K1R7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.34■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
Nek9Q8K1R7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Nek9Q8K1R7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Nek9Q8K1R7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 119.5 ms