Protein–RNA interactions for Protein: Q6NVE8

Wdr44, WD repeat-containing protein 44, mousemouse

Predictions only

Length 915 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr44Q6NVE8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25,61■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25,6■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,6■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,6■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,59■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25,59■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,58■■□□□ 1,69
Wdr44Q6NVE8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,57■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25,57■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC25,56■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25,56■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25,55■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,55■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25,54■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,53■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25,53■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC25,52■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC25,52■■□□□ 1,68
Wdr44Q6NVE8 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,51■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,5■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25,5■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,5■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,49■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25,49■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,48■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25,48■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,47■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25,47■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25,46■■□□□ 1,67
Wdr44Q6NVE8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25,45■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,45■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,44■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25,43■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25,42■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,41■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,4■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,39■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,39■■□□□ 1,66
Wdr44Q6NVE8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25,39■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25,38■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25,38■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25,38■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,37■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,36■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,35■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25,35■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,34■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25,33■■□□□ 1,65
Wdr44Q6NVE8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25,32■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,32■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25,31■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25,31■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25,3■■□□□ 1,64
Wdr44Q6NVE8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25,29■■□□□ 1,64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34,8 ms