Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGK8

Gm5113, Predicted gene 5113, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5113Q3UGK8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Gm5113Q3UGK8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.56■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Gm5113Q3UGK8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Gm5113Q3UGK8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Gm5113Q3UGK8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Gm5113Q3UGK8 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5113Q3UGK8 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Gm5113Q3UGK8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5113Q3UGK8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5113Q3UGK8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Gm5113Q3UGK8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Gm5113Q3UGK8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms