Protein–RNA interactions for Protein: Q3U1C6

Tatdn3, Putative deoxyribonuclease TATDN3, mousemouse

Predictions only

Length 294 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tatdn3Q3U1C6 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Tatdn3Q3U1C6 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.75■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Tatdn3Q3U1C6 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tatdn3Q3U1C6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tatdn3Q3U1C6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.57■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.68
Tatdn3Q3U1C6 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
Tatdn3Q3U1C6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms