Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ04

Gm21887, Predicted gene, 21887, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21887J3QQ04 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21887J3QQ04 Gm13546-201ENSMUST00000135735 401 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21887J3QQ04 Gm7430-201ENSMUST00000193824 1144 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
Gm21887J3QQ04 Gm43275-201ENSMUST00000202053 1020 ntBASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm21887J3QQ04 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
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Gm21887J3QQ04 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.01□□□□□ -0.65
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Gm21887J3QQ04 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
Gm21887J3QQ04 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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Gm21887J3QQ04 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
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Gm21887J3QQ04 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21887J3QQ04 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC10.95□□□□□ -0.66
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Gm21887J3QQ04 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Gm10701-201ENSMUST00000098926 906 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Klk1b7-ps-201ENSMUST00000078897 448 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Slc25a28-201ENSMUST00000046038 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
Gm21887J3QQ04 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.92□□□□□ -0.66
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