Protein–RNA interactions for Protein: P45954

ACADSB, Short/branched chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSBP45954 DEFB113-201ENST00000398718 249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SNORA79B-201ENST00000410557 148 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL049812.3-201ENST00000412348 417 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TMEM196-204ENST00000433641 768 ntTSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RPL7P11-201ENST00000437586 658 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC073052.1-201ENST00000440417 714 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 EIF4EBP2P1-201ENST00000450009 343 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL121584.1-201ENST00000453972 519 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL356981.1-201ENST00000454879 684 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL356390.1-201ENST00000455684 397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL035454.1-201ENST00000470758 433 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 MTND3P6-201ENST00000485242 339 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC005823.2-201ENST00000505978 650 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC011389.1-201ENST00000509170 594 ntTSL 4 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINC02429-202ENST00000513836 694 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 HAPLN1-206ENST00000514416 1145 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 NPM1P52-201ENST00000518264 846 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 EDDM3DP-201ENST00000554692 434 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL391597.1-201ENST00000618707 694 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CR381572.2-201ENST00000624852 397 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RNF123-214ENST00000629802 207 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC002384.2-201ENST00000636036 790 ntTSL 3 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC006994.2-202ENST00000639259 3828 ntTSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 HMCN1-201ENST00000271588 18208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TDO2-208ENST00000536354 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ECT2L-201ENST00000367682 4343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ZNF652P1-201ENST00000442420 1309 ntBASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SEC31A-201ENST00000264405 3447 ntTSL 2 BASIC5.19□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC099654.2-201ENST00000433031 1980 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CD69-201ENST00000228434 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PATJ-213ENST00000613764 4172 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RAP1GDS1-206ENST00000453712 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ZNF117-201ENST00000282869 9080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 XKR4-201ENST00000327381 19880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CNTRL-205ENST00000373850 5824 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ZNF681-201ENST00000402377 6497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC123767.1-201ENST00000519537 1439 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OR10A5-201ENST00000299454 1054 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OR8I2-201ENST00000302124 1010 ntAPPRIS P1 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RNA5SP123-201ENST00000363244 119 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RGS10-201ENST00000369101 738 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ASXL1-203ENST00000375689 812 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL645733.1-201ENST00000402250 217 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AHSA2-203ENST00000410073 479 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 GTF2IP5-201ENST00000414608 731 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SOS1-IT1-201ENST00000420644 539 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CLEC5A-203ENST00000439991 501 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SLC25A18P1-201ENST00000449385 454 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL591363.1-201ENST00000450091 483 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PLGLA-202ENST00000482249 475 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 NIP7P2-201ENST00000485801 544 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CFAP44-AS1-202ENST00000498480 686 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ADGRL3-AS1-202ENST00000504135 542 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RNU6-751P-201ENST00000516382 101 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OR5AZ1P-201ENST00000527448 943 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC008033.2-201ENST00000542626 177 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 LINS1-207ENST00000560133 1196 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC006504.5-212ENST00000587188 746 ntTSL 3 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 QTRT1P1-201ENST00000604344 1078 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 OSER1-AS1-205ENST00000623343 827 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL138828.1-201ENST00000626414 291 ntTSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CASC19-222ENST00000641321 1173 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC073869.10-201ENST00000642016 354 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ABCA13-204ENST00000435803 17184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 IQGAP2-203ENST00000396234 3376 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RNF217-202ENST00000368414 1771 ntTSL 2 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RGS5-212ENST00000618415 5812 ntTSL 4 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC112255.1-201ENST00000624070 2493 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CENPI-204ENST00000423383 2314 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC006148.1-201ENST00000484322 4310 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 GLCE-201ENST00000261858 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 BBX-206ENST00000415149 8930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SLC10A7-203ENST00000432059 3747 ntTSL 1 (best) BASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC011503.2-201ENST00000594230 1500 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC120338.1-201ENST00000625074 1541 ntBASIC5.18□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 BNIP3L-202ENST00000518611 1352 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SCN3A-202ENST00000360093 9123 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PTPRD-201ENST00000355233 8251 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CASC19-204ENST00000641001 2055 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 PLS1-211ENST00000497002 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC097461.1-201ENST00000568928 2821 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RNF217-201ENST00000359704 1784 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC100778.3-201ENST00000580060 1750 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 DDX4-211ENST00000511853 1984 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 ZFX-203ENST00000379177 7558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 CLVS1-205ENST00000519846 3622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RN7SKP104-201ENST00000362605 328 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SNORA74A-201ENST00000364089 198 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SAMD13-202ENST00000370669 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 SAR1A-201ENST00000373236 437 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL590867.1-201ENST00000392385 1212 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 HMGB3P7-201ENST00000400214 611 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 METTL5-204ENST00000409340 472 ntTSL 5 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC098820.3-201ENST00000414135 976 ntTSL 3 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC009502.1-203ENST00000416861 496 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 RCC2P2-201ENST00000422174 918 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 VN1R54P-201ENST00000435210 1049 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AL096855.1-202ENST00000444276 439 ntTSL 2 BASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 AC112498.1-201ENST00000444401 332 ntBASIC5.17□□□□□ -1.58
ACADSBP45954 TTTY22-201ENST00000445253 427 ntTSL 1 (best) BASIC5.17□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.5 ms